Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF3P61204 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARF3P61204 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms