Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms