Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP54P61011 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP54P61011 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP54P61011 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP54P61011 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP54P61011 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP54P61011 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP54P61011 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP54P61011 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP54P61011 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP54P61011 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP54P61011 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP54P61011 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP54P61011 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP54P61011 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP54P61011 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRP54P61011 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRP54P61011 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRP54P61011 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRP54P61011 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms