Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms