Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms