Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms