Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms