Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms