Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPAP49450 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPAP49450 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPAP49450 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPAP49450 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPAP49450 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPAP49450 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms