Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK8P49336 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK8P49336 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms