Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms