Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP5P45974 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP5P45974 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP5P45974 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms