Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms