Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSG1P42857 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSG1P42857 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSG1P42857 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSG1P42857 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSG1P42857 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSG1P42857 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSG1P42857 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSG1P42857 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSG1P42857 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSG1P42857 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSG1P42857 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSG1P42857 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSG1P42857 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSG1P42857 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSG1P42857 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSG1P42857 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSG1P42857 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSG1P42857 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSG1P42857 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSG1P42857 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSG1P42857 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSG1P42857 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSG1P42857 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms