Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms