Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBRP36941 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms