Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms