Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPIFP30405 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPIFP30405 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PPIFP30405 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PPIFP30405 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PPIFP30405 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PPIFP30405 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PPIFP30405 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PPIFP30405 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PPIFP30405 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PPIFP30405 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PPIFP30405 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PPIFP30405 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PPIFP30405 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PPIFP30405 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PPIFP30405 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PPIFP30405 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PPIFP30405 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PPIFP30405 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms