Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD34P28906 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms