Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XPAP23025 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XPAP23025 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XPAP23025 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
XPAP23025 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XPAP23025 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XPAP23025 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XPAP23025 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XPAP23025 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XPAP23025 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XPAP23025 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XPAP23025 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XPAP23025 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XPAP23025 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XPAP23025 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XPAP23025 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms