Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms