Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms