Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF1P18846 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms