Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGAM1P18669 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms