Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms