Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPGDP15428 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPGDP15428 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPGDP15428 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HPGDP15428 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms