Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms