Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL2P13500 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL2P13500 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL2P13500 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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