Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMP3P12645 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BMP3P12645 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMP3P12645 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BMP3P12645 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms