Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP1P11387 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP1P11387 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms