Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms