Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLUP10909 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLUP10909 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLUP10909 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLUP10909 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLUP10909 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLUP10909 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CLUP10909 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CLUP10909 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLUP10909 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLUP10909 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLUP10909 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLUP10909 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLUP10909 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLUP10909 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms