Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PF4V1P10720 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PF4V1P10720 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PF4V1P10720 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PF4V1P10720 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PF4V1P10720 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PF4V1P10720 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4V1P10720 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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