Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB2P05107 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms