Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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