Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms