Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG7O95352 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG7O95352 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATG7O95352 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms