Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms