Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms