Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DENRO43583 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DENRO43583 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DENRO43583 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DENRO43583 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DENRO43583 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms