Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.1 ms