Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3EO15041 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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