Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms