Protein–RNA interactions for Protein: O00533

CHL1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHL1O00533 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHL1O00533 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHL1O00533 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHL1O00533 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHL1O00533 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHL1O00533 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHL1O00533 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms