Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms