Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A8MVJ9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A8MVJ9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A8MVJ9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A8MVJ9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A8MVJ9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A8MVJ9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A8MVJ9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A8MVJ9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A8MVJ9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A8MVJ9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms