Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms