Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDR42E2A6NKP2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms