Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms