Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms